Não existem ensaios clínicos comparando as drogas anti-tireoidianas. Parece que seus efeitos são muito semelhantes. Entretanto o Metimazol (Tapazol®) induz menos agranulocitose e não há relatos deste grave para-efeito em doses até 30mg. A vantagem do Propiltiouracil é que há um bloqueio mais intenso da conversão de T3 em T4 o que o faz mais útil no uso agudo para tratamento das tireotoxicoses graves. Há relatos de ocorrência de agranulocitose mesmo em doses baixas de propiltiouracil.
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Fonte: https://aps.bvs.br/aps/qual-a-melhor-opcao-para-tratamento-medicamentoso-do-hipertireoidismo/ (via RSS)